Shinichi Kudo, un maestru detectiv de saptesprezece ani le-a avut pe toate. El putea rezolva orice caz adus in atentia lui si in timp record. Prietena lui, Ran, era expert in karate, iar tatal ei un detectiv privat care era ros de ideea ca Shinichi primea cele mai interesante cazuri.
Intr-o zi, in timp ce Shinichi si Ran sunt la un parc de distractii, se despart. Shinichi afla de o afacere ilegala ce are loc si spioneaza un grup de barbati imbracati in trenciuri negre. Este prins, iar acestia il otravesc cu o substanta experimentala cu scopul de a-l ucide.
Dar, lucrurile nu se termina aici. Cand Shinichi isi revine, descopera ca a fost redus la dimensiunile unui pusti de generala. El cauta si gaseste ajutor la vecinul sau- inventatorul.
Cand Ran vine sa-l caute pe Shinichi, ei inventeaza o poveste in care Shinichi este un copil pe nume Conan Edogawa.
Ran se ofera sa-i acorde micului Conan un camin atat timp cat familia lui este plecata.
Shinichi isi face o misiune in a-i gasi pe oamenii care l-au otravit si sa gaseasca un antidot.